Die Arbeitsgruppe Biosignalverarbeitung entwickelt automatische Analyseverfahren von sensorbasierten physiologischen Signalen aus der klinischen Praxis.
Diese umfassen dabei das volle Spektrum der Signalverarbeitung, von klassischen Verfahren der Zeitreihenanalyse bis hin zu datengetriebenen Verfahren des tiefen Lernens. Neben der Entwicklung und Verbesserung von bereits existierenden diagnostischen Verfahren forscht die Gruppe ebenfalls im Bereich von grundlegenden Fragestellungen der Signalverarbeitung. Sowohl in der Grundlagen- als auch in der anwendungsorientierten Forschung wird dabei ein großer Wert auf Reproduzierbarkeit und Erklärbarkeit gelegt und Daten sowie Algorithmen werden öffentlich verfügbar gemacht. Ebenso beteiligt sich die Gruppe an klinischen Studien und drittmittelgeförderten Forschungsprojekten. Der Fokus liegt auf der Anwendung der entwickelten Lösungen gemeinsam mit klinischen Partnern (z.B. Kardiologie, Schlafmedizin, Anästhesiologie). Weitere Aktivitäten der Gruppe liegen im außerklinischen Kontext wie z.B. die Verarbeitung von privat erhobenen Daten per Wearables oder Apps.
Darüber hinaus entwickeln wir Werkzeuge und Plattformen zur kollaborativen Forschung und perspektivisch für die klinische Praxis.
Kooperationen und Mitgliedschaften
Die Arbeitsgruppe ist eng verbunden mit der AG Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS) sowie dem Fachausschuss Biosignale der deutschen Gesellschaft für biomedizinische Technik (DGBMT). Ebenso ist die Gruppe involviert in dem Nachwuchsförderungsnetzwerk Young DZHK des Deutschen Zentrums für Herz-Kreislauf-Forschung (DZHK) sowie im Campus-Institut Data Science (CIDAS). Auf internationaler Ebene ist sie aktiv in der IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS) und führt den Vorsitz im deutschen EMBS Chapter.
Präsentationen
Präsentationen in 2022
08/2022: GMDS Jahrestagung, Poster (Theresa Bender)
08/2022: Workshop Biosignals, Keynote (Dr. Nicolai Spicher)
09/2022: Computing in Cardiology, Poster (Dr. Nicolai Spicher)
09/2022: YDZHK Retreat, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)
09/2022: Infinity Conference, Poster (Dr. Nicolai Spicher) / Talk (Theresa Bender)
09/2022: Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Talk (Theresa Bender) / Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher)
Präsentationen in 2023
03/2023: SIAM Conference on Computational Science and Engineering, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)
05/2023: Medical Informatics Europe 2023, Vortrag (Theresa Bender)
06/2023: CIDAS Data Science Kolloquium, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)
07/2023: 45th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Panel (Dr. Nicolai Spicher)
08/2023: 2nd IEEE German Education Conference, Vortrag (Theresa Bender), Workshop (Dr. Nicolai Spicher)
09/2023: 68. Jahrestagung der GMDS, Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher), Poster (Asmus Bart), Poster (Dr. Ennio Idrobo-Avila),
09/2023: 57. Jahrestagung der DGBMT, Vortrag (Theresa Bender), Vortrag (Dr. Henning Dathe), Poster (Philip Gemke), Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher)
09/2023: YDZHK Retreat, Poster (Philip Gemke), Poster (Dr. Nicolai Spicher)
10/2023: CINC 2023, Poster (Philip Gemke), Poster (Philip Zaschke)
12/2023: Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Schlafforschung und Schlafmedizin, Eingeladener Vortrag (Theresa Bender)
Lehre
Die Gruppe bietet im Wintersemester die Veranstaltung “Biosignalverarbeitung” in den B.Sc. Studiengängen Angewandte Informatik und Data Science an. Darüber hinaus werden jederzeit Bachelor-, Master- und Doktorarbeiten zu unseren Forschungsthemen angeboten: Themensammlung. Wenden Sie sich bei Interesse gerne an uns.
Auszeichnungen
- International Summer School BIO-X Fellowship 2023 (Dr. Idrobo-Avila)
- GGNB Travel Grant 2023 (Philip Gemke)
- DAAD RISE Award 2023 (Theresa Bender)
- GWDG Data Science Summer School 2023 (Philip Zaschke)
Publikationen
- Nolte H, Spicher N, Russel A, Ehlers T, Krey S, Krefting D, Kunkel J. Secure HPC: A workflow providing a secure partition on an HPC system. Future Generation Computer Systems. 2022; 141:677-691.
- Bender T, Gemke P, Idrobo-Avila E, Dathe H, Krefting D, Spicher N. Benchmarking the Impact of Noise on Deep Learning-based Classification of Atrial Fibrillation in 12-Lead ECG. In: 33rd Medical Informatics Europe Conference , Gothenburg, Sweden; 2023.
- Gemke P, Spicher N, Kacprowski T. Developing an LSTM-based Listener for Early Detection of Heart Disease. In: Proceedings of the 49th Computing in Cardiology conference, Tampere, Finland; 2022.
- Bender N, Beinecke JM, Krefting D, Müller C, Dathe H, Seidler T, Spicher N, Hauschild AC. Analysis of a Deep Learning Model for 12-Lead ECG Classification Reveals Learned Features Similar to Diagnostic Criteria. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 2023
- Dathe H, Krefting D, Spicher N. Completing the Cabrera Circle: Deriving adaptable leads from ECG limb leads by combining constraints with a correction factor. Physiological Measurement. 2023.
Team
Kontaktinformationen
- Telefon: +49 551 3961527
- E-Mail-Adresse: theresa.bender(at)med.uni-goettingen.de
ORCiD 0000-0001-6721-7034
Kontaktinformationen
- Telefon: +49 551 3961535
- E-Mail-Adresse: henning.dathe(at)med.uni-goettingen.de
ORCiD 0000-0003-0433-4529
Kontaktinformationen
- E-Mail-Adresse: enniohugo.idroboavila(at)med.uni-goettingen.de
Kontaktinformationen
- Telefon: +49 551 3961506
- E-Mail-Adresse: nicolai.spicher(at)med.uni-goettingen.de
Studierende, Hilfskräfte und Absolvent*innen
Studierende
- Asmus Barth
- Robin Giese
- Leon Reimers
- Philip Zaschke
Hilfskräfte
- Tabea Steinbrinker
- Sebastian Schmale
Absolvent*innen
- Susann Bozkir (HAWK M.Eng. 2023)
- Keshav Gandhi (DAAD RISE 2023)
- Meike Knull (Praktikantin 2023)
- Luca Limburg (Praktikant 2023)
Kontakt
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- Telefon: +49 551 3961506
- E-Mail-Adresse: nicolai.spicher(at)med.uni-goettingen.de