Biosignalverarbeitung

Institut für Medizinische Informatik

Die Arbeitsgruppe Biosignalverarbeitung entwickelt automatische Analyseverfahren von sensorbasierten physiologischen Signalen aus der klinischen Praxis.

Diese umfassen dabei das volle Spektrum der Signalverarbeitung, von klassischen Verfahren der Zeitreihenanalyse bis hin zu datengetriebenen Verfahren des tiefen Lernens. Neben der Entwicklung und Verbesserung von bereits existierenden diagnostischen Verfahren forscht die Gruppe ebenfalls im Bereich von grundlegenden Fragestellungen der Signalverarbeitung. Sowohl in der Grundlagen- als auch in der anwendungsorientierten Forschung wird dabei ein großer Wert auf Reproduzierbarkeit und Erklärbarkeit gelegt und Daten sowie Algorithmen werden öffentlich verfügbar gemacht. Ebenso beteiligt sich die Gruppe an klinischen Studien und drittmittelgeförderten Forschungsprojekten. Der Fokus liegt auf der Anwendung der entwickelten Lösungen gemeinsam mit klinischen Partnern (z.B. Kardiologie, Schlafmedizin, Anästhesiologie). Weitere Aktivitäten der Gruppe liegen im außerklinischen Kontext wie z.B. die Verarbeitung von privat erhobenen Daten per Wearables oder Apps.

Darüber hinaus entwickeln wir Werkzeuge und Plattformen zur kollaborativen Forschung und perspektivisch für die klinische Praxis.

Kooperationen und Mitgliedschaften

Die Arbeitsgruppe ist eng verbunden mit der AG Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS) sowie dem Fachausschuss Biosignale der deutschen Gesellschaft für biomedizinische Technik (DGBMT). Ebenso ist die Gruppe involviert in dem Nachwuchsförderungsnetzwerk Young DZHK des Deutschen Zentrums für Herz-Kreislauf-Forschung (DZHK) sowie im Campus-Institut Data Science (CIDAS). Auf internationaler Ebene ist sie aktiv in der IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS) und führt den Vorsitz im deutschen EMBS Chapter.

Präsentationen

Präsentationen in 2024

01/2024: Department of Numerical Analysis, Eötvös-Loránd-Universität Budapest, Eingeladener Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

01/2024: Y-DZHK Retreat Göttingen, Eingeladener Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

Präsentationen in 2023

03/2023: SIAM Conference on Computational Science and Engineering, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

05/2023: Medical Informatics Europe 2023, Vortrag (Theresa Bender) 

06/2023: CIDAS Data Science Kolloquium, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)  

07/2023: 45th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Panel (Dr. Nicolai Spicher)

08/2023: 2nd IEEE German Education Conference, Vortrag (Theresa Bender), Workshop (Dr. Nicolai Spicher)

09/2023: 68. Jahrestagung der GMDS, Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher), Poster (Asmus Bart), Poster (Dr. Ennio Idrobo-Avila),

09/2023: 57. Jahrestagung der DGBMT, Vortrag (Theresa Bender), Vortrag (Dr. Henning Dathe), Poster (Philip Gemke), Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher)

09/2023: YDZHK Retreat, Poster (Philip Gemke), Poster (Dr. Nicolai Spicher)

10/2023: CINC 2023, Poster (Philip Gemke), Poster (Philip Zaschke)

11/2023: Institut für Medizinische Statistik, Informatik und Datenwissenschaften des Universitätsklinikum Jena, Eingeladener Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

11/2023: Ubiquitous Computing Lab, HTWG Konstanz, Eingeladener Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

12/2023: Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Schlafforschung und Schlafmedizin, Eingeladener Vortrag (Theresa Bender)

12/2023: IEEE EMBS International Conference on Data Science and Engineering in Healthcare, Medicine & Biology, Poster (Philip Gemke)

12/2023: IEEE EMBS Tunisia North Africa Forum on Healthcare Innovations, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

Präsentationen in 2022

08/2022: GMDS Jahrestagung, Poster (Theresa Bender)

08/2022: Workshop Biosignals, Keynote (Dr. Nicolai Spicher)

09/2022: Computing in Cardiology, Poster (Dr. Nicolai Spicher)

09/2022: YDZHK Retreat, Vortrag (Dr. Nicolai Spicher)

09/2022: Infinity Conference, Poster (Dr. Nicolai Spicher) / Talk (Theresa Bender)

09/2022: Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Talk (Theresa Bender) / Organisierte Session (Dr. Nicolai Spicher)

Lehre

Die Gruppe bietet im Wintersemester die Veranstaltung “Biosignalverarbeitung” in den B.Sc. Studiengängen Angewandte Informatik und Data Science an. Darüber hinaus werden jederzeit Bachelor-, Master- und Doktorarbeiten zu unseren Forschungsthemen angeboten: Themensammlung. Wenden Sie sich bei Interesse gerne an uns.

Auszeichnungen

  • International Summer School BIO-X Fellowship 2023 (Dr. Idrobo-Avila)
  • GGNB Travel Grant 2023 (Philip Gemke)
  • DAAD RISE Award 2023 (Theresa Bender)
  • GWDG Data Science Summer School 2023 (Philip Zaschke)
  • George B. Moody PhysioNet Challenge 2023 Bester Teamname
  • George B. Moody PhysioNet Challenge 2023 Platzierung 8

Publikationen

 

Team

Biosignalverarbeitung

Theresa Bender, Dr.

Biosignalverarbeitung

PD Dr. rer. nat. Henning Dathe

Biosignalverarbeitung

Philip Hempel, M.Sc.

 Philip Hempel, M.Sc.

Kontaktinformationen

Biosignalverarbeitung

Dr. Ennio Hugo Idrobo-Ávila

Dr. Ennio Hugo Idrobo-Ávila

Kontaktinformationen

Leitung Biosignalverarbeitung

Dr. rer. medic. Nicolai Spicher

Studierende, Hilfskräfte und Absolvent*innen

Studierende

  • Sabine Bader

Hilfskräfte

  • Sebastian Schmale
  • Asmus Barth

Absolvent*innen

  • Susann Bozkir (HAWK M.Eng. 2023)
  • Keshav Gandhi (DAAD RISE 2023)
  • Meike Knull (Praktikantin 2023)
  • Luca Limburg (Praktikant 2023)
  • Robin Giese (Praktikant 2023)
  • Philip Zaschke (M.Sc. 2023)
  • Tabea Steinbrinker (M.Sc. 2023)
  • Leon Reimers (B.Sc. 2023)

 

Kontakt

Leitung Biosignalverarbeitung

Dr. rer. medic. Nicolai Spicher

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