Publications

Institut für Medizinische Informatik

Here you find a list of all publications of the last two years of the Institute of Medical Informatics as well as a list of selected older publications. Questions about our publication activities can be directed to mi(at)med.uni-goettingen.de.

2019

Journal articles 2019

  1. Ammon D, Bietenbeck A, Boeker M, Ganslandt T, Heitmann K, Sax U, Schepers J, Semler SC, Thun S, Zautke A (2019) Der Kerndatensatz der Medizininformatik-Initiative - Interoperable Spezifikation am Beispiel der Laborbefunde mittels LOINC und FHIR. Mdi 21(4): 113-7
  2. Beier M, Penzel T, Krefting D (2019) A Performant Web-Based Visualization, Assessment, and Collaboration Tool for Multidimensional Biosignals. FRONT NEUROINFORM 13: 65, doi: 10.3389/fninf.2019.00065
  3. Birkenkamp A, Bauer CR, Bender T, Knopp C, Sax U (2019) Unlocking OpenData Value: Utilizing the American Gut Project Data Test Bed. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds040
  4. Buckow K, Ammon D, Bild R, Boeker M, Ganslandt R, Haarbrandt B, Haferkamp S, Sax U, Schepers J, Schreiweis B, Stenzhorn H (2019) Interoperabilität - Konvergenz unterschiedlicher Informationsmodelle. Mdi 21(4): 110-2
  5. Ellenberger D, Flachenecker P, Eichstädt K, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Rommer PS, Zettl UK, Stahmann A (2019) Is benign MS "benign"? MULT SCLER J 25(S2): e1, doi: 10.1177/1352458519868080
  6. Glaser A, Stahmann A, Meissner T, Flachenecker P, Horáková D, Zaratin P, Brichetto G, Pugliatti M, Rienhoff O, Vukusic S, de Giacomoni AC, Battaglia MA, Brola W, Butzkueven H, Casey R, Drulovic J, Eichstädt K, Hellwig K, Iaffaldano P, Ioannidou E, Kuhle J, Lycke K, Magyari M, Malbaša T, Middleton R, Myhr KM, Notas K, Orologas A, Otero-Romero S, Pekmezovic T, Sastre-Garriga J, Seeldrayers P, Soilu-Hänninen M, Stawiarz L, Trojano M, Ziemssen T, Hillert J, Thalheim C (2019) Multiple sclerosis registries in Europe - An updated mapping survey. MULT SCLER RELAT DIS 27: 171-178, doi: 10.1016/j.msard.2018.09.032
  7. Jansen C, Penzel T, Hodel S, Breuer S, Spott M, Krefting D (2019) Network physiology in insomnia patients: Assessment of relevant changes in network topology with interpretable machine learning models. CHAOS 29(12): 123129, doi: 10.1063/1.5128003
  8. Kamdje-Wabo G, Gradinger T, Löbe M, Lodahl R, Seuchter SA, Sax U, Ganslandt T (2019) Towards Structured Data Quality Assessment in the German Medical Informatics Initiative: Initial Approach in the MII Demonstrator Study. Stud Health Technol Inform 264: 1508-1509, doi: 10.3233/SHTI190508
  9. Kesztyüs D, Cermak P, Gulich M, Kesztyüs T (2019) Adherence to Time-Restricted Feeding and Impact on Abdominal Obesity in Primary Care Patients: Results of a Pilot Study in a Pre-Post Design. NUTRIENTS 11(12): e1-11, doi: 10.3390/nu11122854
  10. Lehmann C, Suhr M, Umbach N, Cyganek L, Kleinsorge M, Nussbeck SY, Kusch H (2019) Leaving spreadsheets behind – FAIR documentation and representation of human stem cell lines in the Collaborative Research Centre 1002. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds037
  11. Löhnhardt B, Beißbarth T, Sax U (2019) Influence of Big Data and Artificial Intelligence in Biomedical Informatics!? Gms Med Inform Biom Epidemiol 26: e1, doi: 10.3205/19gmds196
  12. Löhnhardt B, Kusch H, Löbe M, Golebiewski M (2019) FAIRe Dateninfrastrukturen für biomedizinische Fachcommunities. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds194
  13. Parciak M, Bauer C, Bender T, Lodahl R, Schreiweis B, Tute E, Sax U (2019) Provenance Solutions for Medical Research in Heterogeneous IT-Infrastructure: An Implementation Roadmap. Stud Health Technol Inform 264: 298-302, doi: 10.3233/SHTI190231
  14. Popp D, Diekmann R, Binder L, Asif AR, Nussbeck SY (2019) Liquid materials for biomedical research: a highly IT-integrated and automated biobanking solution. J LAB MED 43(6): 347-54, doi: 10.1515/labmed-2017-0118
  15. Rheinländer S, Aschenbrandt G, Nussbeck SY, Suhr M, Kusch H (2019) Towards standardized documentation of mouse lines in biomedical basic research. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds038
  16. Rieß EM, Otte A, Bietenbeck A, Ganslandt T, Sax U (2019) LOINC-Mapping von Laborbefunden - Ein Erfahrungsbericht. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds159
  17. Rommer PS, Eichstädt K, Ellenberger D, Flachenecker P, Friede T, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Stahmann A, Zettl UK (2019) Symptomatology and symptomatic treatment in multiple sclerosis: Results from a nationwide MS registry. MULT SCLER J 25(12): 1641-1652, doi: 10.1177/1352458518799580
  18. Rottmann T, Scheel H, Franke T (2019) A generic proxy for privacy preserving communication with applications unfit for external temporary identifiers. Gms Med Inform Biom Epidemiol 16: e1, doi: 10.3205/19gmds029
  19. Scheel H, Dathe H, Franke T, Scharfe T, Rottmann T (2019) A Privacy Preserving Approach to Feasibility Analyses on Distributed Data Sources in Biomedical Research. Stud Health Technol Inform 267: 254-261, doi: 10.3233/SHTI190835
  20. Schmidt P, Pongratz V, Küster P, Meier D, Wuerfel J, Lukas C, Bellenberg B, Zipp F, Groppa S, Sämann PG, Weber F, Gaser C, Franke T, Bussas M, Kirschke J, Zimmer C, Hemmer B, Mühlau M (2019) Automated segmentation of changes in FLAIR-hyperintense white matter lesions in multiple sclerosis on serial magnetic resonance imaging. NEUROIMAGE-CLIN 23: 101849, doi: 10.1016/j.nicl.2019.101849
  21. Stahmann A, Flachenecker P, Fneish F, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Zettl UK, Haas J (2019) Employment outcomes in paediatric onset MS. MULT SCLER J 25(S2): e1, doi: 10.1177/1352458519868080
  22. Suhr M, Umbach N, Meyer T, Zimmermann WH, Sax U (2019) Cardiac Tissue Engineering as Use Case to Connect Biomedical Research Laboratories to an Emerging Global Data Infrastructure. Stud Health Technol Inform 264: 363-367, doi: 10.3233/SHTI190244
  23. Werhahn SM, Dathe H, Rottmann T, Franke T, Vahdat D, Hasenfuß G, Seidler T (2019) Designing meaningful outcome parameters using mobile technology: a new mobile application for telemonitoring of patients with heart failure. ESC HEART FAIL 6(3): 516-525, doi: 10.1002/ehf2.12425
  24. Wiese I, Sarna N, Wiese L, Tashkandi A, Sax U (2019) Concept acquisition and improved in-database similarity analysis for medical data. DISTRIB PARALLEL DAT 37(2): 297-321, doi: 10.1007/s10619-018-7249-x

Book contributions 2019

  1. Linde J, Bartussek A, Throne M, Franke T, Rottmann T, Schaefer C, Nussbeck SY (2019) Synchronisation von Biomaterialdaten zwischen zwei Biomaterialverwaltungssystemen. In: Hummel M, Illig T, Jahns R, Kiehntopf M, Lablans M, Meinung B, Nauck M, Nußbeck SY, Schirmacher P, Semler SC, Specht C (Hg.) 8. Nationales Biobanken-Symposium. Biobanken - Vorreiter für FAIRes Teilen von Daten und Proben in der medizinischen Forschung. Aka Verlag, Berlin, 65-72
  2. Umbach N, Sax U (2019) IT infrastructures and FAIR management of genome sequencing data. In: Duttge G, Sax U, Schweda M, Umbach N (Hg.) Next-Generation Medicine. Mohr Siebeck, Tübingen, 35-44

Editorial Board 2019

  1. Duttge G, Sax U, Schweda M, Umbach N (Hrsg.) Next-Generation Medicine. Mohr Siebeck, Tübingen 2019, ISBN 978-3-16-155861-0
  2. Hummel M, Illig T, Jahns R, Kiehntopf M, Lablans M, Meinung B, Nauck M, Nußbeck SY, Schirmacher P, Semler SC, Specht C (Hg.) 8. Nationales Biobanken-Symposium. Biobanken - Vorreiter für FAIRes Teilen von Daten und Proben in der medizinischen Forschung. Aka Verlag, Berlin 2019, ISBN 978-3-89838-747-7

Posters and congress contributions (without publication source) 2019

  1. Bauer CR, Parciak M, Bender T, Lodahl R, Sax U (2019) Simple Analytics in HiGHmed. Vortrag auf dem i2b2 tranSMART Symposium, 08.-09.10.2019, Tübingen; https://transmartfoundation.org/tubingen-symposium-2019-slides-and-recordings/
  2. Bauer CR, Knopp C, Bender T, Sax U (2019) Göttingen: a peek at the sleek technique, automatique and tweak of SEEK. Vortrag auf dem FAIRDOM PALs & users meeting, 18.-19.07.2019, Heidelberg; https://fairdomhub.org/presentations/801
  3. Ellenberger D, Eichstädt K, Flachenecker P, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Rommer P, Stahmann A, Zettl UK (2019) Unterschiede in der Dauer bis zur Multiplen Sklerose – Diagnosestellung in Deutschland. Vortrag auf dem 92. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Neurologie, 25.-28.09.2019, Stuttgart
  4. Nyoungui E, Mercier L, Esslinger K, Pischek-Koch K, Wache S, Schmucker M, Dietrich M, Haag M, Rienhoff O, Blaschke S (2019) OPTINOFA – Entwicklung eines intelligenten Assistenzdienstes zur strukturierten Ersteinschätzung von Behandlungsdringlichkeit und Versorgungsstufe in der Notaufnahme. Kongressbeitrag zur 14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft Interdisziplinäre Notfall- und Akutmedizin (DGINA), 14.-16.11.2019, Bremen
  5. Richter J (2019) Wie profitieren Patienten, Behandler und Forscher vom UMG-MeDIC? Posterbeitrag zum 5. Workshop Antibiotikaresistenz des RKI, 14.-15.11.2019, Berlin
  6. Sax U, Bauer C, Bender T (2019) Interoperability and Data Integration aspects of the HiGHmed project within the German Medical Informatics Initiative. Vortrag auf dem i2b2 tranSMART Foundation Symposium at Harvard Medical School, 17.-18.06.2019, Boston, MA
  7. Sellemann B, Vogel S, Güttler K, Zebbities S, Przysucha M, Hüsers J, Hübner U (2019) Multiprofessionelle Entscheidungsunterstützung im Kontext chronischer Wunden. Kongressbeitrag zur 10. European Nursing Informatics (ENI), 05.-06.09.2019, Flensburg
  8. Stahmann A, Ellenberger D, Flachenecker P, Fneish F, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Rommer P, Spiekerkötter LM, Zettl UK (2019) Unterschiede in der Zeit bis zur ersten krankheitsmodifizierenden Therapie bei MS-Erkrankten mit schubförmigem Verlauf in Deutschland. Vortrag auf dem 92. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Neurologie, 25.-28.09.2019, Stuttgart

Göttingen Research Online (GRO) 2019

  1. Bingert S, Engelhardt C, Kusch H (2019) Handlungsempfehlungen zu Forschungsdatenmanagement und -infrastruktur an Hochschulstandorten, doi: 10.25625/PAYCKB
  2. Roertgen S; Kusch H, Engelhardt C, Bingert S, Savin V, Kraus I, Brand O, Dierkes J, Curdt C, Löschen C, Vompras J, Paul-Stüve T, Schwandt S (2019) Posters presented at "Workshop zu Forschungsdatenmanagement und -infrastruktur in DFG-Sonderforschungsbereichen", 26.-27.11.2018, Göttingen, doi: 10.25625/22y1wc
  3. Roertgen S; Kusch H, Engelhardt C, Bingert S, Savin V, Kraus I, Brand O, Dierkes J, Curdt C, Löschen C, Vompras J, Paul-Stüve T, Schwandt S (2019) Presentations and material of "Workshop zu Forschungsdatenmanagement und -infrastruktur in DFG-Sonderforschungsbereichen", 26.-27.11.2018, Göttingen, doi: 10.25625/97D6TL
  4. Roertgen S, Kusch H, Engelhardt C, Bingert S, Savin V, Wang Y, Rice R, Elsenga C, Stokes P, Donaldson M, Ebert B (2019) Workshop on data management costs and efforts, 28.05.2019, Göttingen, doi: 10.25625/NTRUKA

Master Theses 2019

  1. Pruss D, MSc (2019) Medizinische Terminologieservices in einem systematischen Review. Masterarbeit Universität Göttingen.
  2. Richter J, MSc (2019) Entwicklung eines Dokumentationsleitfadens für den Software-Entwicklungsprozess von Clinical Decision Support Systems (CDSS). Masterarbeit Universität Göttingen.

2018

Journal articles 2018

  1. Apweiler R, Beissbarth T, Berthold MR, Blüthgen N, Burmeister Y, Dammann O, Deutsch A, Feuerhake F, Franke A, Hasenauer J, Hoffmann S, Höfer T, Jansen PLM, Kaderali L, Klingmüller U, Koch I, Kohlbacher O, Kuepfer L, Lammert F, Maier D, Pfeifer N, Radde N, Rehm M, Roeder I, Saez-Rodriguez J, Sax U, Schmeck B, Schuppert A, Seilheimer B, Theis FJ, Vera J, Wolkenhauer O (2018) Whither systems medicine? EXP MOL MED 50: e453-8, doi: 10.1038/emm.2017.290
  2. Bauer CR, Knopp C, Bender T, Kusch H, Sax U (2018) Application of basic research data management with FAIRDOM/SEEK from a medical informatics perspective. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds093
  3. Bender T, Bauer CR, Parciak M, Lodahl R, Sax U (2018) FAIR conform ETL processing in translational research. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds095
  4. Dathe H, Krüger H (2018) Morphometric findings on the Nebra Sky Disc. Time and Mind 11(1): 89-104, doi: 10.1080/1751696X.2018.1433358
  5. Ellenberger D, Eichstädt K, Flachenecker P, Friede T, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Stahmann A, Zettl UK, Rommer PS (2018) Decreasing longitudinal use of glucocorticosteroids in multiple sclerosis. MULT SCLER RELAT DIS 25: 173-4, doi: 10.1016/j.msard.2018.07.040
  6. Ganslandt T, Boeker M, Löbe M, Prasser F, Schepers J, Semler SC, Thun S, Sax U (2018) Der Kerndatensatz der Medizininformatik-Initiative: Ein Schritt zur Sekundärnutzung von Versorgungsdaten auf nationaler Ebene. Mdi 20(1): 17-21
  7. Haarbrandt B, Schreiweis B, Rey S, Sax U, Scheithauer S, Rienhoff O, Knaup-Gregori P, Bavendiek U, Dieterich C, Brors B, Kraus I, Thoms C, Jaeger D, Ellenrieder V, Bergh B, Yahyapour R, Eils R, Marschollek M (2018) HiGHmed - An Open Platform Approach to Enhance Care and Research across Institutional Boundaries. METHOD INFORM MED Suppl. 01(57): e66-e81, doi: 10.3414/ME18-02-0002
  8. Knaup P, Deserno TM, Prokosch HU, Sax U (2018) Implementation of a National Framework to Promote Health Data Sharing. The German Medical Informatics Initiative. Yearb Med Inform 27(1): 302-4, doi: 10.1055/s-0038-1641210
  9. Knopp C, Bauer CR, Kusch H, Sax U (2018) Usage of persistent identifiers to implement the FAIR guiding principles in medical research data management systems. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds172
  10. Kraus I, Nyoungui E, Vogel S, Suhr M, Rienhoff O (2018) Decades of Learning in Medical Decision Support - Mapped into a Blended Learning Module for Health Professionals. Medicinska Informatika 14: 25-6
  11. Lodahl R, Bauer CR, Baum B, Bender T, Parciak M, Krawczak M, Sax U (2018) Enabling Pedigree Visualization and Analysis in tranSMART. Stud Health Technol Inform 253: 75-9, doi: 10.3233/978-1-61499-896-9-75
  12. Loehnhardt B, Sax U, Beissbarth T (2018) Multi-omics data analysis. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds195
  13. Nesemann K, Braus-Stromeyer SA, Harting R, Höfer A, Kusch H, Ambrosio AB, Timpner C, Braus GH (2018) Fluorescent pseudomonads pursue media-dependent strategies to inhibit growth of pathogenic Verticillium fungi. APPL MICROBIOL BIOT 102(2): 817-831, doi: 10.1007/s00253-017-8618-5
  14. Parciak M, Bauer CR, Lodahl R, Thoms C, Kusch H, Rey S, Sax U (2018) PROV@TOS, a Java Wrapper to capture provenance for Talend Open Studio jobs. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds096
  15. Przysucha M, Vogel S, Hüsers J, Wache S, Sellemann B, Hübner U (2018) Requirements for Collaborative Decision Support Systems in Wound Care: No Information Continuity Without Management Continuity. Stud Health Technol Inform 253: 133-7, doi: 10.3233/978-1-61499-896-9-133
  16. Pung J, Hügel J, Bauer CR, Rienhoff O (2018) Processing and object-oriented modeling of primary care data (BDT) for scientific use. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds020
  17. Rommer PS, Eichstädt K, Ellenberger D, Flachenecker P, Friede T, Haas J, Kleinschnitz C, Pöhlau D, Rienhoff O, Stahmann A, Zettl UK (2018) Symptomatology and symptomatic treatment in multiple sclerosis: Results from a nationwide MS registry. MULT SCLER J -: e1-e12, doi: 10.1177/1352458518799580
  18. Suhr M, Jahn N, Mietchen D, Kusch H (2018) Wikidata as semantic representation platform of the scientific achievements of the biomedical Collaborative Research Centre 1002. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds173
  19. Thiel S, Leypoldt F, Röpke L, Wandinger K, Kümpfel T, Aktas O, von Bismarck O, Salmen A, Ambrosius B, Ellrichmann G, Antony G, Dankowski T, Ziegler A, Stahmann A, Meyer C, Eichstädt K, Buckow K, Meissner T, Thibaut J, Khil L, Berger K, Gold R, Hellwig K (2018) Neuroimmunologische Register in Deutschland. Aktuel Neurol 45(1): 7-23
  20. Thiel S, Leypoldt F, Röpke L, Wandinger KP, Kümpfel T, Aktas O, von Bismarck O, Salmen A, Ambrosius B, Ellrichmann G, Antony G, Dankowski T, Ziegler A, Stahmann A, Meyer C, Eichstädt K, Buckow K, Meißner T, Thibaut J, Khil L, Berger K, Gold R, Hellwig K (2018) Neuroimmunological Registries in Germany. Neurology International Open 2: e25-e39, doi: 10.1055/s-0043-108830
  21. Umbach N, Flatau L, Bauer CR, Beissbarth T, Duttge G, Perera-Bel J, Schulte R, Schulze TG, Schweda M, Trostmann J, Sax U (2018) Public attitudes, expectations, and fears regarding storage, disclosure, and distribution of sequencing data in research and clinical contexts. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds008
  22. Umbach N, Freckmann L, Knopp C, Meyer T, Suhr M, Kusch H (2018) From seamless acquisition and sustainable management to publication of next-generation sequencing data. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds098
  23. Vogel S, Przysucha M, Wache S, Hüsers J, Hübner U, Sellemann B (2018) Decision support use cases for the treatment of patients with chronic wounds. Gms Med Inform Biom Epidemiol 15: e1, doi: 10.3205/18gmds025
  24. Werhahn SM, Dathe H, Rottmann T, Franke T, Wheeler C, Fili M, Hasenfuss G, Seidler T (2018) Validity of activity data collected by mobile Apple devices - Testing a new telemedical care concept for patients after hospitalization for heart failure. EUR HEART J 39(Suppl. 1): e1106, doi: 10.1093/eurheartj/ehy565.1106
  25. Wiese I, Sarna N, Wiese L, Tashkandi A, Sax U (2018) Concept acquisition and improved in-database similarity analysis for medical data. DISTRIB PARALLEL DAT 36: 1-25, doi: 10.1007/s10619-018-7249-x
  26. Zettl U, Eichstädt K, Ellenberger D, Flachenecker P, Friede T, Haas J, Kleinschnitz C, Meyer C, Pöhlau D, Rienhoff O, Rommer P, Stahmann A (2018) MS in Deutschland: Symptome und Behandlungsdefizite. Neurotransmitter 29(6): 42-4, doi: 10.1007/s15016-018-6423-8

Conference contributions 2018

  1. Bönisch C, Ballout S (2018) open EHR – the „open platform” revolution. Tutorial at the 11th international SWAT4HLCS Conference 2018, December 3-6, Antwerp, Belgium
  2. Kusch H, Wache S, Kraus I, Engelhardt C, Bingert S (2018) What will Sustainable Research Data Management Cost? Determination of Factors to Estimate the Financial Requirements of FAIR Research Data Handling. Presented at CODATA RDM Symposium, March 18-20, Göttingen
  3. Kusch H, Nußbeck SY, Királi P, Macneil R, Crosas M (2018) Pilot Integration of an Electronic Lab Notebook and an Open Source Research Data Repository as Part of a Modular Biomedical Research Data Platform. Presented at CODATA RDM Symposium, March 18-20, Göttingen
  4. Krause E, Kusch H, Tate D (2018) Introducing electronic laboratory notebooks (ELNs): What are they and how can information professionals support their use. Presented at EAHIL 2018 Continuing Education Courses, July 9-13, Cardiff
  5. Kusch H (2018) Enabling connectivity in electronic laboratory note keeping – a pilot approach in biomedical sciences. Presented at Digital Notebooks – Productivity Tools for Researchers, March 21, Delft
  6. Vogel S, Wache S, Rienhoff O, Przysucha M, Hüsers J, Hübner U, Güttler K, Zebbities S, Sellemann B (2018) Computer Assisted Wound Management in Wound Monitoring. Presented at 2nd International Conference on Nursing Science and Practice, August 6-8, London.

Posters 2018

  1. Bender T, Bauer CR, Baum B, Kindle G, Knecht C, Franke A, Krawczak M, Sax U (2018) Systems Medicine at Work: Exploring Beta Diversity of the Microbiome in tranSMART as an Interactive Heatmap Including Phenotype Information. Presented at e:Med Meeting 2018, September 24-26, Berlin
  2. Engelhardt C, Bingert S, Kusch H (2018) Exploring the Costs and Scalability of Research Data Management Services: Göttingen Research Data Exploratory. Presented at IDCC, February 19-22, Barcelona
  3. Pung J, Schmidt J, Diekmann R, Schulze TG, Rienhoff O (2018) Zentrales Datenmanagement im Forschungsverbund Bipolare Störungen BipoLife. Presented at BMBF Forschungsnetztreffen für psychische Erkrankungen, April 19-20, Marburg
  4. Senner F, Pung J, Rietschel M, Witt S, Rienhoff O, Schulze TG (2018) NetBi-omics – data exchange for distributed biobanks in the investigation of mental illness. Presented at XXVI World Congress of Psychiatric Genetics, October 11-15, Glasgow

Master Theses 2018

  1. Omokolo Ndoungue EG, MSc (2018) Konzept zur modell- und terminologieunterstützten Integration von Daten mit openEHR und SNOMED CT. Masterarbeit Universität Göttingen.
  2. Suhr M, MSc (2018) Concept for acquisition and storage of process data and metadata to improve traceability and reproducibility in biomedicine. Masterarbeit Universität Göttingen.

2017

Journal articles 2017

  1. Bahari-Javan S, Varbanov H, Halder R, Benito E, Kaurani L, Burkhardt S, Anderson-Schmidt H, Anghelescu I, Budde M, Stilling RM, Costa J, Medina J, Dietrich DE, Figge C, Folkerts H, Gade K, Heilbronner U, Koller M, Konrad C, Nussbeck SY, Scherk H, Spitzer C, Stierl S, Stöckel J, Thiel A, von Hagen M, Zimmermann J, Zitzelsberger A, Schulz S, Schmitt A, Delalle I, Falkai P, Schulze TG, Dityatev A, Sananbenesi F, Fischer A (2017) HDAC1 links early life stress to schizophrenia-like phenotypes. P NATL ACAD SCI USA 114(23): E4686-E4694, doi: 10.1073/pnas.1613842114
  2. Baum B, Bauer CR, Franke T, Kusch H, Parciak M, Rottmann T, Umbach N, Sax U (2017) Opinion paper: Data provenance challenges in biomedical research. Information Technology (IT) 59(4): 191-6, doi: 10.1515/itit-2016-0031
  3. Baum B, Bauer CR, Nußbeck G, Sax U (2017) Migration of intensive care unit (ICU) data into a medical research data mart. Gms Med Inform Biom Epidemiol -: 152, doi: 10.3205/17gmds152
  4. Blumentritt A, Hauswaldt J, Pung J, Heinemann S, Hummers-Pradier E (2017) Routine Anonymized Data for Advanced Ambulatory Health Services Research, RADAR. Ger Med Sci 15: -, doi: 10.3205/17dkvf413
  5. Chaplinskaya-Sobol I, Lee M, Schmidt J, Rienhoff O (2017) Neuer Wein in alten Schläuchen? Neuaufstellung der Medizinischen Dokumentation im Kontext Data Science. Mdi 19(1): 8-10
  6. Dathe H, Rottmann T, Franke T (2017) Wearables - Ein erster Schritt mit der Apple Watch. Gms Med Inform Biom Epidemiol -: 139, doi: 10.3205/17gmds139
  7. de Vries RP, Riley R, Wiebenga A, Aguilar-Osorio G, Amillis S, Uchima CA, Anderluh G, Asadollahi M, Askin M, Barry K, Battaglia E, Bayram Ö, Benocci T, Braus-Stromeyer SA, Caldana C, Cánovas D, Cerqueira GC, Chen F, Chen W, Choi C, Clum A, Dos Santos RAC, Damásio ARdL, Diallinas G, Emri T, Fekete E, Flipphi M, Freyberg S, Gallo A, Gournas C, Habgood R, Hainaut M, Harispe ML, Henrissat B, Hildén KS, Hope R, Hossain A, Karabika E, Karaffa L, Karányi Z, Kraševec N, Kuo A, Kusch H, LaButti K, Lagendijk EL, Lapidus A, Levasseur A, Lindquist E, Lipzen A, Logrieco AF, MacCabe A, Mäkelä MR, Malavazi I, Melin P, Meyer V, Mielnichuk N, Miskei M, Molnár ÁP, Mulé G, Ngan CY, Orejas M, Orosz E, Ouedraogo JP, Overkamp KM, Park HS, Perrone G, Piumi F, Punt PJ, Ram AFJ, Ramón A, Rauscher S, Record E, Riaño-Pachón DM, Robert V, Röhrig J, Ruller R, Salamov A, Salih NS, Samson RA, Sándor E, Sanguinetti M, Schütze T, Sepčić K, Shelest E, Sherlock G, Sophianopoulou V, Squina FM, Sun H, Susca A, Todd RB, Tsang A, Unkles SE, van de Wiele N, van Rossen-Uffink D, Oliveira JVdC, Vesth TC, Visser J, Yu JH, Zhou M, Andersen MR, Archer DB, Baker SE, Benoit I, Brakhage AA, Braus GH, Fischer R, Frisvad JC, Goldman GH, Houbraken J, Oakley B, Pócsi I, Scazzocchio C, Seiboth B, vanKuyk PA, Wortman J, Dyer PS, Grigoriev IV (2017) Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. GENOME BIOL 18(1): 28, doi: 10.1186/s13059-017-1151-0
  8. Flatau J, Umbach N, Sax U, Beißbarth T, Duttge G, Schweda M, Schulze TG (2017) The Use of Genomic Information in Medical Practice: A Survey on People's Knowledge, Expectations, and Fears. EUR NEUROPSYCHOPHARM 27(S3): 369, doi: 10.1016/j.euroneuro.2016.09.396
  9. Frölich L, Peters O, Lewczuk P, Gruber O, Teipel SJ, Gertz HJ, Jahn H, Jessen F, Kurz A, Luckhaus C, Hüll M, Pantel J, Reischies FM, Schröder J, Wagner M, Rienhoff O, Wolf S, Bauer C, Schuchhardt J, Heuser I, Rüther E, Henn F, Maier W, Wiltfang J, Kornhuber J (2017) Incremental value of biomarker combinations to predict progression of mild cognitive impairment to Alzheimer's dementia. ALZHEIMERS RES THER 9(1): 84, doi: 10.1186/s13195-017-0301-7
  10. Hansen BO, Meyer EH, Ferrari C, Vaid N, Movahedi S, Vandepoele K, Nikoloski Z, Mutwil M (2017) Ensemble gene function prediction database reveals genes important for complex I formation in Arabidopsis thaliana. NEW PHYTOL 217(4): 1521-34, doi: 10.1111/nph.14921
  11. Hübner U, Przysucha M, Wache S, Vogel S (2017) Intelligente Versorgung von Menschen mit chronischen Wunden. Mdi 19(4): 108-11
  12. Lodahl R, Bauer CR, Baum B, Sax U (2017) Visualizing patient cohort data in tranSMART: a phenotype toolbox. Gms Med Inform Biom Epidemiol -: 151, doi: 10.3205/17gmds151
  13. Meissner T, Buckow K, Baum B (2017) Processing of heterogeneous MS register data within the EUReMS project. International Journal of Population Data Science 1(1): 271, doi: 10.23889/ijpds.v1i1.291
  14. Parciak M, Bauer CR, Baum B, Kusch H, Sax U (2017) Technical Aspects of Data Provenance in Clinical Trials. Gms Med Inform Biom Epidemiol -: 155, doi: 10.3205/17gmds155
  15. Schulte G, Hübner U, Rienhoff O, Quade M, Rottmann T, Fenske M, Egbert N, Kuhlisch R, Sellemann B (2017) Evaluation einer elektronisch unterstützten pflegerischen Überleitung zwischen Krankenhaus und Pflegeheim unter Nutzung einer Test-Telematikinfrastruktur: eine Fallanalyse. Gms Med Inform Biom Epidemiol 13(1): 1-10, doi: 10.3205/mibe000172
  16. Umbach N, Beißbarth T, Duttge G, Flatau L, Kuhn-Aldea J, Perera-Bel J, Roschauer J, Schulze TG, Schweda M, Trostmann J, Urban A, Zimmermann A, Sax U (2017) Challenges and Recommendations for Managing Genomic High-Throughput Data in the Clinic. Gms Med Inform Biom Epidemiol -: 71, doi: 10.3205/17gmds071

Master Theses 2017

  1. Bender T, MSc (2017) A tranSMART plugin for the analysis of small RNA data with OASIS. Masterarbeit Universität Göttingen.
  2. Lodahl R, MSc (2017) Optionen zur Darstellung und Analyse von Verwandtschaftsverhältnissen in medizinischen Forschungsdatenbanken. Masterarbeit Universität Göttingen.
  3. Oschmann G, MSc (2017) Unterstützung und Evaluation der Migration einer Projekt- und Ressourcenmanagement-Lösung im Kontext der gesamten Systemlandschaft des Bereichs "Forschung und Entwicklung" der Otto Bock HealthCare GmbH am Standort Duderstadt. Masterarbeit Universität Göttingen.
  4. Parciak M, MSc (2017) Provenancekonzept für Datenbestände aus einer heterogenen Forschungsinfrastruktur (am Beispiel einer klinischen Forschergruppe). Masterarbeit Universität Göttingen.

2016

Journal articles 2016

  1. Bauer CRKD, Ganslandt T, Baum B, Christoph J, Engel I, Löbe M, Mate S, Stäubert S, Drepper J, Prokosch HU, Winter A, Sax U (2016) Integrated Data Repository Toolkit (IDRT). A Suite of Programs to Facilitate Health Analytics on Heterogeneous Medical Data. Method Inform Med 55(2): 125-35, doi: 10.3414/ME15-01-0082
  2. Bauer CR, Knecht C, Fretter C, Baum B, Jendrossek S, Rühlemann M, Heinsen FA, Umbach N, Grimbacher B, Franke A, Lieb W, Krawczak M, Hütt MT, Sax U (2016) Interdisciplinary approach towards a systems medicine toolbox using the example of inflammatory diseases. BRIEF BIOINFORM 17(2): 1-9, doi: 10.1093/bib/bbw024
  3. Bauer CR, Umbach N, Baum B, Buckow K, Franke T, Grütz R, Gusky L, Nussbeck SY, Quade M, Rey S, Rottmann T, Rienhoff O, Sax U (2016) Architecture of a Biomedical Informatics Research Data Management Pipeline. Stud Health Technol Inform 228: 262-6
  4. Dathe H, Gezzi R, Fiedler C, Kubein-Meesenburg D, Nägerl H (2016) The description of the human knee as four-bar linkage. ACTA BIOENG BIOMECH 18(4): 107-115
  5. Droege G, Barker K, Seberg O, Coddington J, Benson E, Berendsohn WG, Bunk B, Butler C, Cawsey EM, Deck J, Döring M, Flemons P, Gemeinholzer B, Güntsch A, Hollowell T, Kelbert P, Kostadinov I, Kottmann R, Lawlor RT, Lyal C, Mackenzie-Dodds J, Meyer C, Mulcahy D, Nussbeck SY, O'Tuama É, Orrell T, Petersen G, Robertson T, Söhngen C, Whitacre J, Wieczorek J, Yilmaz P, Zetzsche H, Zhang Y, Zhou X (2016) The Global Genome Biodiversity Network (GGBN) Data Standard specification. DATABASE-OXFORD 2016: 1-11, doi: 10.1093/database/baw125
  6. Jo P, Nietert M, Gusky L, Kitz J, Conradi LC, Müller-Dornieden A, Schüler P, Wolff HA, Rüschoff J, Ströbel P, Grade M, Liersch T, Beißbarth T, Ghadimi MB, Sax U, Gaedcke J (2016) Neoadjuvant Therapy in Rectal Cancer - Biobanking of Preoperative Tumor Biopsies. SCI REP-UK 6: 35589, doi: 10.1038/srep35589
  7. Löbe M, Ganslandt T, Lotzmann L, Mate S, Christoph J, Baum B, Sariyar M, Wu J, Stäubert S (2016) Simplified Deployment of Health Informatics Applications by Providing Docker Images. Stud Health Technol Inform 228: 643-7
  8. Nussbeck SY, Rabone M, Benson EE, Droege G, Mackenzie-Dodds J, Lawlor RT (2016) "Life in Data" - Outcome of a Multi-Disciplinary, Interactive Biobanking Conference Session on Sample Data. BIOPRESERV BIOBANK 14(1): 56-64, doi: 10.1089/bio.2015.0061
  9. Peters O, Heuser I, Frölich L, Rüther E, Rienhoff O, Kornhuber J, Wiltfang J, Maier W (2016) Das Kompetenznetz Demenzen - Erfolge und Ausblicke. BUNDESGESUNDHEITSBLA 59(4): 438-43
  10. Rienhoff O (2016) Integration of Information for Patient Care: 2015 Redux. Yearb Med Inform Suppl 1: S21-2, doi: 10.15265/IYS-2016-s015
  11. Rienhoff O (2016) Nicht verstaubt und quicklebendig. E-Health-Com 02(11): 24-6
  12. Ritter PS, Bermpohl F, Gruber O, Hautzinger M, Jansen A, Juckel G, Kircher T, Lambert M, Mulert C, Pfennig A, Reif A, Rienhoff O, Schulze TG, Severus E, Stamm T, Bauer M (2016) Aims and structure of the German Research Consortium BipoLife for the study of bipolar disorder. Int J Bipolar Disord 4(1): 26, doi: 10.1186/s40345-016-0066-0
  13. Sax U, Lipprandt M, Röhrig R (2016) The Rising Frequency of IT Blackouts Indicates the Increasing Relevance of IT Emergency Concepts to Ensure Patient Safety. Yearb Med Inform 2016(1): 130-137, doi: 10.15265/IY-2016-038
  14. Sellemann B, Flemming D (2016) Die Pflege, unendliche Weiten. E-Health-Com 02(11): 58-61

Book contributions 2016

  1. Buckow K, Rienhoff O (2016) Mobile IT-Werkzeuge. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2015. Aka Verlag, Berlin, 127-46
  2. Buckow K, Dathe H, Rottmann T, Rienhoff O (2016) Mobile IT-Werkzeuge. In: Drepper J, Semler EC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2016. Aka Verlag, Berlin, 143-64
  3. Franke T, Sax U (2016) Erhebung, Management und Verarbeitung digitaler Bilder. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2015. Aka Verlag, Berlin, 73-86
  4. Franke T, Sax U (2016) Erhebung, Management und Verarbeitung digitaler Bilder. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2016. Aka Verlag, Berlin, 79-94
  5. Kraus M, Kühn A, Seyler C, Dösch A, Schwaneberg T, Weitmann K, Weis T, Meder B, Sandek A, Karthe J, Wachter R, Edelmann F, Hübler S, Knosalla C, von Stülpnagel L, Bauer A, Ledwoch J, Krockenberger K, Desch S, Riesinger LM, Summo C, Mehr M, Wakili R, Geidel L, Stahl D, Bahls T, Lee M, Rottmann T, Franke T, Hoffmann J, Bayrak A, Lesser S, Wichmann HE (2016) Informierte Einwilligung im Deutschen Zentrum für Herz-Kreislauf-Forschung e. V. (DZHK). In: Illig T, Hummel M, Jahns R, Kiehntopf M, Lieb W, Nauck M, Nussbeck SY, Prokosch H-U, Schirmacher P, Semler SC, Siddiqui RA (Hrsg.) Biobanken als Bindeglied zwischen Versorgung und Forschung. Tagungsband des 5. Nationalen Biobanken-Symposiums 2016. Aka Verlag, Berlin, 129-40
  6. Nussbeck SY, Prokosch HU (2016) Biobanken. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2016. Aka Verlag, Berlin, 95-114
  7. Nussbeck SY, Leb I, Skrowny D, Prokosch HU (2016) Biobanken. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2015. Aka Verlag, Berlin, 87-102
  8. Sax U, Bauer CR, Ganslandt T, Kirsten T (2016) Forschungsdatenmanagement. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2015. Aka Verlag, Berlin, 173-84
  9. Sax U, Bauer CR, Ganslandt T, Kirsten T (2016) Forschungsdatenmanagement. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2016. Aka Verlag, Berlin, 195-210
  10. Umbach N, Beißbarth T, Sax U (2016) Molekularbiologische Daten aus Hochdurchsatz-Analysen. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2015. Aka Verlag, Berlin, 103-26
  11. Umbach U, Beissbarth T, Sax U (2016) Molekularbiologische Daten aus Hochdurchsatz-Analysen. In: Drepper J, Semler SC (Hrsg.) IT-Infrastrukturen in der patientenorientierten Forschung. Aktueller Stand und Handlungsbedarf 2016. Aka Verlag, Berlin, 115-42

Habilitationen

  1. Nußbeck SY (2016) Data quality management in multi-centre longitudinal clinical research projects. Habilitation Universität Göttingen.

Master Theses 2016

  1. Baum B, MSc (2016) Analyse, Migration und Visualisierung von hochfrequenten Intensivmedizindaten für die medizinische Forschung. Masterarbeit Universität Göttingen.
  2. Bauer CR, MSc (2016) Aspekte der Erschließung komplexer Datenbestände in der translationalen Forschung. Masterarbeit Universität Göttingen.
  3. Bitzmann H, MSc (2016) Erfassung der Schultergelenkswinkel mithilfe von Inertialsensorik und Anwendung bezüglich anerkannter ergonomischer Bewertungsmethoden. Masterarbeit Universität Göttingen.

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